Protein–RNA interactions for Protein: E9PVI0

Vmn2r34, Vomeronasal 2, receptor 34, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r34E9PVI0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r34E9PVI0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r34E9PVI0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r34E9PVI0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r34E9PVI0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r34E9PVI0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r34E9PVI0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r34E9PVI0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r34E9PVI0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r34E9PVI0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r34E9PVI0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r34E9PVI0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r34E9PVI0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r34E9PVI0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn2r34E9PVI0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r34E9PVI0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms