Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FgaE9PV24 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FgaE9PV24 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FgaE9PV24 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FgaE9PV24 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FgaE9PV24 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FgaE9PV24 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FgaE9PV24 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FgaE9PV24 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FgaE9PV24 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FgaE9PV24 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FgaE9PV24 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FgaE9PV24 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FgaE9PV24 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FgaE9PV24 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms