Protein–RNA interactions for Protein: E0CYQ0

Kctd17, MCG13350, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd17E0CYQ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd17E0CYQ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd17E0CYQ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd17E0CYQ0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd17E0CYQ0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd17E0CYQ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd17E0CYQ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd17E0CYQ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd17E0CYQ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd17E0CYQ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd17E0CYQ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Kctd17E0CYQ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kctd17E0CYQ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd17E0CYQ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd17E0CYQ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd17E0CYQ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd17E0CYQ0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd17E0CYQ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kctd17E0CYQ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kctd17E0CYQ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kctd17E0CYQ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kctd17E0CYQ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kctd17E0CYQ0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kctd17E0CYQ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kctd17E0CYQ0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kctd17E0CYQ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kctd17E0CYQ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kctd17E0CYQ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kctd17E0CYQ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kctd17E0CYQ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kctd17E0CYQ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kctd17E0CYQ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kctd17E0CYQ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kctd17E0CYQ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kctd17E0CYQ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kctd17E0CYQ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kctd17E0CYQ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kctd17E0CYQ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kctd17E0CYQ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd17E0CYQ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kctd17E0CYQ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms