Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7A4

Gm21560, Predicted gene, 21560, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21560D3Z7A4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm21560D3Z7A4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm21560D3Z7A4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21560D3Z7A4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21560D3Z7A4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21560D3Z7A4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21560D3Z7A4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms