Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn2r49D3Z6L3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r49D3Z6L3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r49D3Z6L3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r49D3Z6L3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r49D3Z6L3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r49D3Z6L3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r49D3Z6L3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r49D3Z6L3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r49D3Z6L3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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