Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930595D18RikD3Z642 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930595D18RikD3Z642 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930595D18RikD3Z642 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930595D18RikD3Z642 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930595D18RikD3Z642 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930595D18RikD3Z642 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930595D18RikD3Z642 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930595D18RikD3Z642 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930595D18RikD3Z642 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930595D18RikD3Z642 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930595D18RikD3Z642 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930595D18RikD3Z642 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930595D18RikD3Z642 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930595D18RikD3Z642 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930595D18RikD3Z642 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930595D18RikD3Z642 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930595D18RikD3Z642 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930595D18RikD3Z642 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930595D18RikD3Z642 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930595D18RikD3Z642 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930595D18RikD3Z642 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930595D18RikD3Z642 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms