Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp6ap1lD3Z5W0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp6ap1lD3Z5W0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp6ap1lD3Z5W0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp6ap1lD3Z5W0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp6ap1lD3Z5W0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp6ap1lD3Z5W0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp6ap1lD3Z5W0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp6ap1lD3Z5W0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp6ap1lD3Z5W0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp6ap1lD3Z5W0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms