Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Ptrhd1D3Z4S3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Ptrhd1D3Z4S3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Ptrhd1D3Z4S3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Ptrhd1D3Z4S3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ptrhd1D3Z4S3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ptrhd1D3Z4S3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ptrhd1D3Z4S3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ptrhd1D3Z4S3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Ptrhd1D3Z4S3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22,52■■□□□ 1,2
Ptrhd1D3Z4S3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ptrhd1D3Z4S3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ptrhd1D3Z4S3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ptrhd1D3Z4S3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ptrhd1D3Z4S3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ptrhd1D3Z4S3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ptrhd1D3Z4S3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Ptrhd1D3Z4S3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Ptrhd1D3Z4S3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ptrhd1D3Z4S3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ptrhd1D3Z4S3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ptrhd1D3Z4S3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,19
Ptrhd1D3Z4S3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Ptrhd1D3Z4S3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22,39■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22,38■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22,36■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22,34■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,33■■□□□ 1,17
Ptrhd1D3Z4S3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,32■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22,3■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22,29■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Ptrhd1D3Z4S3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ptrhd1D3Z4S3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22,26■■□□□ 1,15
Ptrhd1D3Z4S3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ptrhd1D3Z4S3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,25■■□□□ 1,15
Ptrhd1D3Z4S3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Ptrhd1D3Z4S3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,7 ms