Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3M1

Vmn2r125, Vomeronasal 2, receptor 125, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r125D3Z3M1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r125D3Z3M1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r125D3Z3M1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r125D3Z3M1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r125D3Z3M1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r125D3Z3M1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r125D3Z3M1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r125D3Z3M1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r125D3Z3M1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r125D3Z3M1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r125D3Z3M1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r125D3Z3M1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r125D3Z3M1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r125D3Z3M1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r125D3Z3M1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r125D3Z3M1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r125D3Z3M1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r125D3Z3M1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r125D3Z3M1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r125D3Z3M1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r125D3Z3M1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r125D3Z3M1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vmn2r125D3Z3M1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r125D3Z3M1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r125D3Z3M1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn2r125D3Z3M1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r125D3Z3M1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r125D3Z3M1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r125D3Z3M1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r125D3Z3M1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r125D3Z3M1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r125D3Z3M1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r125D3Z3M1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r125D3Z3M1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r125D3Z3M1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r125D3Z3M1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms