Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1500009C09RikD3YYW9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1500009C09RikD3YYW9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1500009C09RikD3YYW9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1500009C09RikD3YYW9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1500009C09RikD3YYW9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1500009C09RikD3YYW9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1500009C09RikD3YYW9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1500009C09RikD3YYW9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1500009C09RikD3YYW9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms