Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700015F17RikD3YUK8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700015F17RikD3YUK8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700015F17RikD3YUK8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms