Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm17333C6EQI3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm17333C6EQI3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17333C6EQI3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm17333C6EQI3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm17333C6EQI3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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