Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcb5B5X0E4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcb5B5X0E4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcb5B5X0E4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcb5B5X0E4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcb5B5X0E4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcb5B5X0E4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcb5B5X0E4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcb5B5X0E4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcb5B5X0E4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcb5B5X0E4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcb5B5X0E4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcb5B5X0E4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcb5B5X0E4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcb5B5X0E4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcb5B5X0E4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcb5B5X0E4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcb5B5X0E4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcb5B5X0E4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcb5B5X0E4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcb5B5X0E4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcb5B5X0E4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcb5B5X0E4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb5B5X0E4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb5B5X0E4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb5B5X0E4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb5B5X0E4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb5B5X0E4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb5B5X0E4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb5B5X0E4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcb5B5X0E4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcb5B5X0E4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Abcb5B5X0E4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcb5B5X0E4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcb5B5X0E4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcb5B5X0E4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcb5B5X0E4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcb5B5X0E4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcb5B5X0E4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcb5B5X0E4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcb5B5X0E4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms