Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trappc11B2RXC1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trappc11B2RXC1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc11B2RXC1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trappc11B2RXC1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc11B2RXC1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc11B2RXC1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trappc11B2RXC1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trappc11B2RXC1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trappc11B2RXC1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc11B2RXC1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc11B2RXC1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc11B2RXC1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc11B2RXC1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trappc11B2RXC1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc11B2RXC1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc11B2RXC1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trappc11B2RXC1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc11B2RXC1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trappc11B2RXC1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms