Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a28B2RT89 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a28B2RT89 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a28B2RT89 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a28B2RT89 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a28B2RT89 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc22a28B2RT89 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a28B2RT89 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a28B2RT89 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc22a28B2RT89 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc22a28B2RT89 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc22a28B2RT89 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc22a28B2RT89 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc22a28B2RT89 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms