Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Phactr2B1AVP0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Phactr2B1AVP0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Phactr2B1AVP0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Phactr2B1AVP0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Phactr2B1AVP0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Phactr2B1AVP0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Phactr2B1AVP0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Phactr2B1AVP0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Phactr2B1AVP0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Phactr2B1AVP0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms