Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cavin4A2AMM0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cavin4A2AMM0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cavin4A2AMM0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cavin4A2AMM0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cavin4A2AMM0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cavin4A2AMM0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cavin4A2AMM0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cavin4A2AMM0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cavin4A2AMM0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cavin4A2AMM0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cavin4A2AMM0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cavin4A2AMM0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cavin4A2AMM0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cavin4A2AMM0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cavin4A2AMM0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cavin4A2AMM0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cavin4A2AMM0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cavin4A2AMM0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cavin4A2AMM0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cavin4A2AMM0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cavin4A2AMM0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cavin4A2AMM0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cavin4A2AMM0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cavin4A2AMM0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cavin4A2AMM0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cavin4A2AMM0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cavin4A2AMM0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cavin4A2AMM0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cavin4A2AMM0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cavin4A2AMM0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cavin4A2AMM0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cavin4A2AMM0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cavin4A2AMM0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cavin4A2AMM0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Cavin4A2AMM0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cavin4A2AMM0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cavin4A2AMM0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cavin4A2AMM0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cavin4A2AMM0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cavin4A2AMM0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cavin4A2AMM0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cavin4A2AMM0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cavin4A2AMM0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Cavin4A2AMM0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cavin4A2AMM0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cavin4A2AMM0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cavin4A2AMM0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cavin4A2AMM0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cavin4A2AMM0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Cavin4A2AMM0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cavin4A2AMM0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cavin4A2AMM0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cavin4A2AMM0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cavin4A2AMM0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cavin4A2AMM0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cavin4A2AMM0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cavin4A2AMM0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cavin4A2AMM0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cavin4A2AMM0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms