Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hacd4A2AKM2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd4A2AKM2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hacd4A2AKM2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd4A2AKM2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms