Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm12A2AJ77 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm12A2AJ77 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm12A2AJ77 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm12A2AJ77 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm12A2AJ77 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm12A2AJ77 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm12A2AJ77 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm12A2AJ77 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm12A2AJ77 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm12A2AJ77 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prdm12A2AJ77 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm12A2AJ77 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm12A2AJ77 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm12A2AJ77 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm12A2AJ77 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm12A2AJ77 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm12A2AJ77 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm12A2AJ77 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm12A2AJ77 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm12A2AJ77 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm12A2AJ77 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms