Protein–RNA interactions for Protein: A2A9Q0

Fndc10, Fibronectin type III domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc10A2A9Q0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc10A2A9Q0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc10A2A9Q0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc10A2A9Q0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc10A2A9Q0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc10A2A9Q0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc10A2A9Q0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc10A2A9Q0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc10A2A9Q0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc10A2A9Q0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc10A2A9Q0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc10A2A9Q0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc10A2A9Q0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc10A2A9Q0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc10A2A9Q0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc10A2A9Q0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc10A2A9Q0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc10A2A9Q0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc10A2A9Q0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc10A2A9Q0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc10A2A9Q0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc10A2A9Q0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms