Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RlfA2A7F4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RlfA2A7F4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RlfA2A7F4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RlfA2A7F4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RlfA2A7F4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RlfA2A7F4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RlfA2A7F4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RlfA2A7F4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RlfA2A7F4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RlfA2A7F4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RlfA2A7F4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RlfA2A7F4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RlfA2A7F4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RlfA2A7F4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RlfA2A7F4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RlfA2A7F4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RlfA2A7F4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RlfA2A7F4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RlfA2A7F4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RlfA2A7F4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RlfA2A7F4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RlfA2A7F4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RlfA2A7F4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RlfA2A7F4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RlfA2A7F4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RlfA2A7F4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RlfA2A7F4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RlfA2A7F4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RlfA2A7F4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RlfA2A7F4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms