Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdc27A2A6Q5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc27A2A6Q5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc27A2A6Q5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc27A2A6Q5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc27A2A6Q5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc27A2A6Q5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc27A2A6Q5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc27A2A6Q5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdc27A2A6Q5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdc27A2A6Q5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdc27A2A6Q5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdc27A2A6Q5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdc27A2A6Q5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdc27A2A6Q5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdc27A2A6Q5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdc27A2A6Q5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdc27A2A6Q5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdc27A2A6Q5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdc27A2A6Q5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdc27A2A6Q5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdc27A2A6Q5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdc27A2A6Q5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc27A2A6Q5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdc27A2A6Q5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc27A2A6Q5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc27A2A6Q5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc27A2A6Q5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc27A2A6Q5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc27A2A6Q5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc27A2A6Q5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc27A2A6Q5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc27A2A6Q5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc27A2A6Q5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdc27A2A6Q5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdc27A2A6Q5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc27A2A6Q5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms