Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc112A0AUP1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc112A0AUP1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc112A0AUP1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc112A0AUP1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc112A0AUP1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc112A0AUP1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc112A0AUP1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc112A0AUP1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc112A0AUP1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc112A0AUP1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc112A0AUP1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc112A0AUP1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc112A0AUP1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc112A0AUP1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc112A0AUP1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc112A0AUP1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc112A0AUP1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc112A0AUP1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc112A0AUP1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc112A0AUP1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc112A0AUP1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc112A0AUP1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc112A0AUP1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc112A0AUP1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc112A0AUP1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc112A0AUP1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc112A0AUP1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc112A0AUP1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc112A0AUP1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc112A0AUP1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc112A0AUP1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc112A0AUP1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc112A0AUP1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc112A0AUP1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc112A0AUP1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc112A0AUP1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc112A0AUP1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc112A0AUP1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc112A0AUP1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc112A0AUP1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc112A0AUP1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms