Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0U1RNP2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0U1RNP2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0U1RNP2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0U1RNP2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0U1RNP2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0U1RNP2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0U1RNP2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0U1RNP2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0U1RNP2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0U1RNP2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0U1RNP2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0U1RNP2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0U1RNP2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0U1RNP2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0U1RNP2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0U1RNP2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0U1RNP2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0U1RNP2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0U1RNP2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0U1RNP2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0U1RNP2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0U1RNP2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RNP2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RNP2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A0U1RNP2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms