Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms