Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19,14■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19,14■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19,14■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19,13■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19,12■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19,12■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,11■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Trbv19A0A0B4J1H4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,08■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19,07■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19,07■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19,06■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,06■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19,06■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19,05■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19,05■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19,05■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19,04■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19,04■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19,04■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19,03■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19,02■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Trbv19A0A0B4J1H4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Trbv19A0A0B4J1H4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,01■□□□□ 0,63
Trbv19A0A0B4J1H4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Trbv19A0A0B4J1H4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Trbv19A0A0B4J1H4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Trbv19A0A0B4J1H4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18,99■□□□□ 0,63
Trbv19A0A0B4J1H4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Trbv19A0A0B4J1H4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Trbv19A0A0B4J1H4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Trbv19A0A0B4J1H4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Trbv19A0A0B4J1H4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Trbv19A0A0B4J1H4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18,92■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18,9■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18,9■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18,9■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,9■□□□□ 0,62
Trbv19A0A0B4J1H4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Trbv19A0A0B4J1H4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Trbv19A0A0B4J1H4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Trbv19A0A0B4J1H4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Trbv19A0A0B4J1H4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Trbv19A0A0B4J1H4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Trbv19A0A0B4J1H4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Trbv19A0A0B4J1H4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18,86■□□□□ 0,61
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