Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQQ0

Gm28557, Predicted gene 28557, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28557A0A087WQQ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28557A0A087WQQ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28557A0A087WQQ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28557A0A087WQQ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28557A0A087WQQ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28557A0A087WQQ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28557A0A087WQQ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28557A0A087WQQ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28557A0A087WQQ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28557A0A087WQQ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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