Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 USP32P1-203ENST00000417524 1014 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RPL5P4-201ENST00000434805 886 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 STARD13-IT1-201ENST00000456087 452 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 PDE4DIP-241ENST00000616206 874 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL390882.1-201ENST00000618821 594 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL139806.1-201ENST00000403057 1002 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CLEC4E-206ENST00000545274 730 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 OR4N3P-201ENST00000559395 818 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms