Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL161747.2-201ENST00000535893 472 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ANGPT1-206ENST00000520734 1526 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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