Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 HSD3BP5-201ENST00000434856 1132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 CASK-AS1-201ENST00000451126 515 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL592043.2-201ENST00000454146 743 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC123768.2-201ENST00000500941 732 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL133520.1-201ENST00000610430 700 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 EEF1A1P4-201ENST00000359165 1405 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 HLA-DRA-201ENST00000374982 1169 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RBMY2FP-202ENST00000420346 1263 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RNF11P2-201ENST00000427702 440 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 SLC17A1-203ENST00000468082 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 NTAN1P2-201ENST00000515730 940 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC090568.2-203ENST00000521433 579 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 SNRPCP14-201ENST00000524498 205 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC087521.3-202ENST00000526408 743 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RAP1B-230ENST00000543697 734 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PCED1B-AS1-206ENST00000550426 683 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PCED1B-AS1-211ENST00000552990 654 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC025280.1-201ENST00000562393 260 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL804P-201ENST00000582466 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ZNF208-202ENST00000597040 781 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ZNF257-207ENST00000600162 817 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC111188.3-201ENST00000604663 307 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC016999.2-201ENST00000614692 556 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL157392.3-206ENST00000614899 822 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL031772.1-216ENST00000619494 697 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AP000769.3-201ENST00000622944 536 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC00595-211ENST00000634735 535 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL158175.1-203ENST00000635654 1281 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms