Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 GSTM1-203ENST00000369819 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL356273.2-201ENST00000413701 973 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC01425-202ENST00000430060 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC00545-201ENST00000440633 411 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL19P-201ENST00000462522 306 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC108073.1-201ENST00000508231 674 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC091951.4-201ENST00000512746 332 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC244131.1-201ENST00000542152 922 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC005841.1-201ENST00000547042 287 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 DDIT3-205ENST00000552740 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL109628.2-201ENST00000554037 201 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC009269.2-201ENST00000559892 474 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC091132.5-205ENST00000585761 560 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC026950.2-201ENST00000633456 470 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 SULT1C2-202ENST00000326853 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL078621.1-201ENST00000272567 768 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 ADGRF2-201ENST00000296862 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 OR14I1-201ENST00000342623 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC243547.1-201ENST00000415065 408 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMGB1P1B2RPK0 RPL5P28-201ENST00000418634 693 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms