Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC016629.2-201ENST00000597341 199 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RBM5-AS1-201ENST00000630404 1386 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC017007.5-201ENST00000511590 874 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 TUBD1-206ENST00000539018 1027 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 LRP1-AS-201ENST00000554476 325 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 TEX46-202ENST00000566855 510 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 KRTAP3-3-201ENST00000391586 704 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD12P35452 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms