Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 C6orf106-201ENST00000374021 916 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AL604028.1-201ENST00000430643 598 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AL450384.2-202ENST00000436485 656 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC091730.1-201ENST00000440455 692 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 LINC02556-201ENST00000450776 346 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ZNF32-AS1-201ENST00000453284 434 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 LINC01103-201ENST00000430551 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 SFR1-201ENST00000369727 1438 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 GYG1P2-201ENST00000426437 1006 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCN2BO60939 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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