Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CHCHD7-205ENST00000517933 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC103409.1-201ENST00000521199 564 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CHCHD7-215ENST00000523061 557 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC021755.3-201ENST00000560376 864 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 FADS2P1-201ENST00000611807 1446 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 Z99943.2-201ENST00000507585 266 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC244502.1-205ENST00000535351 571 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 USP2-AS1-205ENST00000578923 895 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RPL5P27-201ENST00000437011 881 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms