Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms