Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RCE1Q9Y256 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms