Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP21Q9UK80 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP21Q9UK80 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP21Q9UK80 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP21Q9UK80 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP21Q9UK80 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms