Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA1Q9UIW2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA1Q9UIW2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms