Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN11AQ9UI33 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms