Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms