Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms