Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB4Q9NTQ9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms