Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLE4Q9NR33 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms