Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms