Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFDQ9GZP0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms