Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC4A5Q9BY07 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms