Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRIP1Q9BX63 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRIP1Q9BX63 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms