Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
LRRIQ1Q96JM4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRIQ1Q96JM4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
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