Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPD52L3Q96J77 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms