Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPC1Q8WXF1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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